主要区别如下：

1. 研究领域：自然基金主要支持自然科学领域的研究，如数学、物理、化学、生物学等自然科学学科的基础研究和应用研究。社科基金主要支持社会科学领域的研究，如经济学、政治学、社会学、心理学、教育学等社会科学学科的基础研究和应用研究。

2. 申请要求：自然基金的申请者通常需要具备自然科学相关学科的背景和研究能力，如自然科学院所、大学自然科学院所属教师、研究人员等。社科基金的申请者通常需要具备社会科学相关学科的背景和研究能力，如社会科学院所、大学社会科学院所属教师、研究人员等。

3. 资金用途：自然基金的资金主要用于支持自然科学研究项目的开展，包括科研设备购置、实验材料费用、研究人员薪酬等。社科基金的资金主要用于支持社会科学研究项目的开展，包括调研费用、数据采集与分析费用、研究人员薪酬等。

4. 评审标准：自然基金的评审主要考察研究项目的科学性、创新性和实施可行性等自然科学相关的指标。社科基金的评审主要考察研究项目的学术价值、理论贡献和实际应用价值等社会科学相关的指标。

需要注意的是，自然基金和社科基金都是由中国国家自然科学基金委员会（NSFC）和中国国家社会科学基金委员会（NSSF）负责管理和资助的国家级科研项目，旨在促进科学技术和社会科学的发展。