二级建造师不注册不会作废。考生取得二级建造师资格证书之后，可以在三年内申请初始注册，逾期为初始注册的，符合继续教育条件也可申请初始注册。

二级建造师初始注册者，可自资格证书签发之日起3年内提出申请。逾期未申请者，须符合本专业继续教育的要求后方可申请初始注册。

申请初始注册需要提交下列材料：

1、注册建造师初始注册申请表。

2、资格证书、学历证书和身份证明复印件。

3、申请人与聘用单位签订的聘用劳动合同复印件或其他有效证明文件。

4、逾期申请初始注册的，应当提供达到继续教育要求的证明材料。

取得二级建造师资格证书不注册话只是不能以二级建造师名义执业，所以不注册的话资格证书不会失效，但是二级建造师注册证书有效期为三年，每三年需要延续注册一次。