运输发票的抵扣税率主要取决于发票类型和纳税人类型。以下是具体的抵扣规则：

增值税专用发票

一般纳税人：抵扣11%。

小规模纳税人：抵扣7%。

公路内河运输发票

一般纳税人：抵扣11%。

小规模纳税人：抵扣7%。

其他运输服务发票

国内旅客运输服务：

航空运输电子客票行程单：进项税额 = （票价 + 燃油附加费） ÷ （1 + 9%） × 9%。

铁路车票：进项税额 = 票面金额 ÷ （1 + 9%） × 9%。

公路、水路等其他客票：进项税额 = 票面金额 ÷ （1 + 3%） × 3%。

通行费电子普通发票

道路通行费：抵扣进项税额 = 收费公路通行费增值税电子普通发票上注明的增值税额。

桥、闸通行费：可抵扣进项税额 = 桥、闸通行费发票上注明的金额 ÷ （1 + 5%） × 5%。

建议

一般纳税人：在取得增值税专用发票时，应确保正确计算抵扣金额，并注意区分不同类型的运输服务和通行费发票，以便按规定进行抵扣。

小规模纳税人：在取得运输发票时，应确认发票类型，并按照7%的税率计算抵扣金额。

企业：在实际操作中，建议咨询当地税务局或专业税务顾问，以确保符合最新的税收政策和规定。