物流公司的货运税率主要取决于纳税人种类（一般纳税人或小规模纳税人）以及所提供的服务类型。

一般纳税人

9%：适用于提供交通运输服务，包括陆路运输、水路运输、航空运输、管道运输以及无运输工具承运业务等。此外，邮政服务如邮政普通服务、邮政特殊服务和其他邮政服务也适用9%的税率。

10%：根据《财政部国家税务总局关于调整增值税税率的通知》，从2018年5月1日起，运输服务的税率由11%降为10%。

小规模纳税人

3%：小规模纳税人则按3%的征收率征收增值税。

建议

一般纳税人：如果您的公司是作为一般纳税人进行货物运输服务，建议选择9%的税率，因为这是目前适用的标准税率。

小规模纳税人：如果您的公司是作为小规模纳税人进行货物运输服务，则必须按照3%的税率进行缴税。

请根据您的公司类型和服务内容，选择正确的税率进行税务申报。