教育部门并没有说首都医科大学是一本还是二本大学，首都医科大学是几本只是民间说法，到底是一本还是二本要根据所在省份（市）招生批次确定。

首都医科大学在北京是本科批次招生，在外省是第一批次招生，所以我们通常认为首都医科大学是一本大学。