嘉兴学院与嘉兴南湖学院的区别是：成立时间不同：嘉兴学院成立于2000年3月。

嘉兴学院南湖学院成立于2003年。类别不同：嘉兴学院属于公立大学。而嘉兴学院南湖学院属于独立学院，且南湖学院是嘉兴学院下的独立学院。