二本院校和三本院校区别很大。

主要区别是二本为公办、三本院校为民办院校。普通二本大学指的是录取批次放在第二批的大学，每个省的情况都不一样。比如山东师范大学，在外省是放在普通二本批次录取的，但是在山东本省就是一本(包括重点本、普通1本)录取。