南京师范大学设有二级学院28个，开办本科专业99个。

拥有国家“双一流”建设学科1个，国家重点学科6个、国家重点（培育）学科3个，江苏高校优势学科10个，江苏省一级学科重点学科13个。在全国第四轮学科评估中，2个学科获得A，4个学科获得A-，5个学科获得B+。

8个学科进入ESI全球前1%。