内蒙古医科大学的学校校徽为圆形图案，由红、绿、蓝三色组成。

校徽的外环是由“内蒙古医科大学”的蒙、汉、英三种文字构成；核心部分是用软笔草体书法写成的“内医”首字母N、Y；数字“1956”，代表学校建校时间。

内蒙古医科大学校徽的设计集中体现了内蒙古的特色融合了医科学科的独特性。

校训:博学、尚行、精诚、至善。

校歌:《理想之歌》。