福州大学研究生在福州大学旗山校区。

福州大学于2005年开始以筹建形式成立研究生院。目前在校各类研究生已达到8400多人，是福建省唯一的全国专业学位研究生教育综合改革试点高校和全国工程硕士研究生教育创新院校。