方向不同：专业型硕士，主要工作是针对于临床工作而言的，未来的方向就是和病人直接接触的医生，专硕又被称为临床型硕士。

而学术型硕士，主要培养方向是该生的医学科研能力，未来的方向就是搞研究，朝医学科学家的方向发展的，所以，该类型又被称为科研型硕士。