南京审计大学属于本科一批院校。南京审计学院，2015年11月18日更名为南京审计大学，是江苏省属重点建设高校。学校与国家审计署同时诞生，与中国审计事业同步发展，是中国唯一以"审计"命名的高等学府，是中国审计高等教育发源地之一。

南京审计大学起源于1983年的南京财贸学院。1987年更为南京审计学院，由审计署和南京市人民政府联办。1991年转制为审计署直属。2000年办学体制调整为江苏省人民政府与审计署合作共建，以江苏省人民政府管理为主。

南京审计大学是唯一以“审计”命名的全日制普通本科院校，为我国审计高等教育发源地之一，因审而立、为审而存、依审而兴、靠审而强。2015年经教育部批准更名为南京审计大学，2018年与中央军委审计署签署战略合作框架协议。

2015年5月，全国审计专业学位研究生教育指导委员会发布审计硕士专业学位授权点专项评估工作方案，学校审计硕士专业学位授权点专项评估综合得分排名全国第一。