1、管理依据不同，参公事业单位的人员尽管在事业编制序列，单却按照公务员管理办法进行管理，即实行的是公务员管理制度，一般事业单位实行的是事业单位人事管理制度。

2、招录方式不同，参公事业单位的人员招录必须遵守《公务员录用规定》等法律法规的规定。一般事业单位的招录必须按照单位公开招聘的一系列规定执行。

3、设立条件不同，参公事业单位应同时具备两个条件，第一要有法律、法规授权的公共事务管理职能。第二使用事业编制，并由国家财政负担工资福利。一般事业单位的设立条件是满足由国家机关举办或者其他组织利用国有资产举办的，从事教育、科技、文化、卫生等活动即可。

4、享有的资源待遇不同，参公事业单位的工作人员一般近似于等同公务员的福利待遇。同时该参公事业单位比起一般事业单位，具备更高的权威性和公信力。而一般事业单位在单位与国家机关之间进行交流是比较困难的，职业发展空间相对较小。